Al regresar a su hogar en Konohagakure, el joven ninja celebra haber derrotado a un grupo de supuestos miembros de Akatsuki. Naruto Uzumaki y Sakura Haruno, sin embargo, se sienten diferentes. Naruto está celoso de las familias de felicitaciones de sus camaradas, deseando la presencia de sus propios padres. Sakura, por otro lado, está enojada con sus padres vergonzosos y desea no tener padres en absoluto. Los dos chocan por sus ideales opuestos, pero se enfrentan a un asunto más apremiante cuando Madara Uchiha enmascarado aparece de repente y los transporta a un mundo alternativo.
En este mundo, los padres de Sakura son considerados héroes, ya que dieron sus vidas para proteger a Konohagakure del ataque del zorro de nueve colas hace 10 años. En consecuencia, los padres de Naruto, Minato Namikaze y Kushina Uzumaki, están vivos y bien. Incapaces de regresar a casa o encontrar a Madara enmascarada, Naruto y Sakura se quedan en este nuevo mundo y disfrutan de los cambios que siempre han anhelado. Todo parece ir bien para los dos ninjas, hasta que surge una amenaza inesperada que empuja a Naruto y Sakura no solo a luchar por el Konohagakure del mundo alternativo, sino también a encontrar el camino de regreso al suyo.
