Hace cincuenta años, un gigante extraterrestre de luz conocido como Ultraman salvó la tierra pero desapareció. El anfitrión humano de Ultraman, Shin Hayata, se quedó sin memoria de su época como héroe. Se descubre que el hijo pequeño de Hayata, Shinjirou, nació con un cuerpo más poderoso y duradero que cualquier humano normal. La organización que ayudó a Ultraman, la SSSP, le revela el pasado de Hayata. Luego, su padre vuelve a ponerse un traje de poder, asumiendo el papel de Ultraman una vez más.
Una noche, Shinjirou es atacado por un extraterrestre llamado Bemular y rescatado por su padre, quien resulta gravemente herido en la batalla. Con peligrosos extraterrestres acechando en la ciudad y Hayata fuera de servicio, le corresponde a Shinjirou tomar la antorcha. Pero al trabajar con SSSP como el nuevo Ultraman, Shinjirou se pregunta hasta dónde está dispuesto a llegar para ayudar a la gente.